Kostel sv. Vojtěcha se rozprostírá na jihovýchodním rohu Krakovském rynku, který je považován za největší středověké náměstí v Evropě. Tento kostel je jedním z nejstarších kostelů v Polsku. Jeho základy jsou nejspíše nejstarší stavbou ve městě.
Legenda říká, že na místě dnešního kostela konal kázání svatý Vojtěch. Na jeho památku zde byl vybudován malý kamenný kostel. Dnešní románský kostel byl postaven v druhé polovině 11. století. Avšak první dřevěný kostel na tomto místě vznikl patrně už kolem roku 1000. První informace o kostelu pocházejí z roku 1250.
V letech 1611 – 1618 byl kostel přestavěn v barokním stylu. Přestavbu podnítil profesor a rektor Jagellonské univerzity Walenty Fontany. V té době byly kostelu zvýšeny stěny, loď se pokryla barokní kupolí a byl vybudován nový portál ze západní strany. V roce 1711 byla přistavěna sakristie, v roce 1726 dřevěná kaple sv. Jana Nepomuckého, která byla v roce 1778 přebudována na zděnou a které byl v roce 1781 změněn název a patronem kaple se stal Wincenty Kadlubek.
Pozice kostela narušuje symetričnost Krakovského rynku, jelikož budova kostela při umístění náměstí v roce 1257 už byla postavená. V okolí kostela procházela krakovská královská cesta, která vedla ze čtvrti Kleparz, přes Floriánskou bránu a náměstí až ke Královskému hradu Wawel. Vzhledem k tomu, že úroveň náměstí od 13. do 17. století vzrostla, je současný vstup do kostela asi o 2 metry výše než byl ten prvotní.
